Zapewne określonych korzyści oczekuje też Skarb Państwa, uznając, że płatnicy popełniać będą mniej błędów w rocznych rozliczeniach, dzięki czemu, określone zasoby aparatu skarbowego zostaną uwolnione.
Jednakże korzyści jakie odniosą beneficjenci zostaną sfinansowane z prywatnych środków innych osób, co stanowi ewidentny przejaw nieuczciwego zarządzania państwem.

Działanie przeciwko sektorowi małych przedsiębiorstw
PKPP Lewiatan zwraca uwagę, że ok. 1 mln obywateli Polski to mali przedsiębiorcy prowadzący indywidualną działalność gospodarczą, jednocześnie zatrudniający pracowników. Dla osób tych już dziś problemem dnia codziennego jest prawidłowe stosowanie przepisów podatkowych. Nałożenie na nich dodatkowych obowiązków i dodatkowej odpowiedzialności związanej ze stosowaniem tych przepisów, w związku ze sporządzaniem rozliczeń rocznych osób trzecich (pracowników), jest bez wątpienia rozwiązaniem wymierzonym przeciwko tej grupie społecznej, i tym samym pozostaje w całkowitej sprzeczności z deklarowanym przez rząd wspieraniem małej oraz średniej przedsiębiorczości w Polsce.

Zwiększenie kosztów po stronie przedsiębiorców bez odpowiedniej rekompensaty – złamanie zasady nakładania obowiązków publicznych z zapewnieniem właściwego wynagrodzenia
W ocenie PKPP Lewiatan (co jest zgodne z tezami zawartymi w rządowym uzasadnieniu do projektu ustawy) nowelizacja przyczyni się bezpośrednio do podwyższenia kosztów administracyjnych płatników, zobowiązanych do przygotowania rocznych zeznań podatkowych.

Pracodawcy poniosą dodatkowe koszty w związku z:

1. Zebraniem danych od pracowników (oświadczeń)
2. Wprowadzeniem danych do systemu księgowego
3. Archiwizacją danych
4. Archiwizacją oświadczeń pracowniczych
5. Sporządzeniem rocznego rozliczenia
6. Zakupem/dostosowaniem systemu (powtarzany co rocznie w związku ze zmieniającymi się przepisami)
7. Wysyłką rozliczenia rocznego
8. Wyliczeniem i potrąceniem dopłaty do podatku
9. Transferem środków na rachunek US
10. Szkoleniami/aktualizacją wiedzy na temat PIT
11. Kontaktami z urzędem skarbowym, w związku z korektami, wyjaśnieniami
12. Zwiększonym ryzykiem podatkowym, związanym z potencjalną odpowiedzialnością za nieprawidłowe rozliczenie podatku pracownika

Koszty zostaną poniesione jako koszty własne albo w ramach zwiększonej ceny outsourcingu usług księgowo-podatkowych.

Największe koszty zostaną poniesione w I roku, w związku z istotnym dostosowaniem systemów księgowych. Większość kosztów nie będzie miała jednak charakteru jednorazowego i będą musiały być ponoszone w kolejnych latach. W konsekwencji powyższe czynniki wpłynąć mogą na obniżenie dochodowości polskich pracodawców, zwłaszcza w niekorzystnej obecnie sytuacji gospodarczej. Zdziwienie Konfederacji budzi także moment zaproponowanych zmian, gdyż obecnie w związku z dekoniunkturą, państwo powinno wspierać przedsiębiorców wszelkimi możliwymi sposobami.

Przewidziany w uzasadnieniu wzrost wynagrodzenia dla płatników ze stawki 0,3 % na 0,35% lub 0,4 % w ocenie PKPP Lewiatan nie pokryje kosztów obowiązków dla płatnika, obejmujących sporządzenie rozliczenia rocznego pracownika z uwzględnieniem niektórych ulg jak i obowiązków dotychczas występujących związanych z obsługą roczną pracownika w zakresie obliczania i odprowadzania zaliczek.

Przyjmując, że wartość średniego wynagrodzenia pracowniczego wynosi w Polsce 2.800 zł, co w konsekwencji daje przeciętną kwotę uiszczanego podatku PIT w skali roku na poziomie 5.000 zł. - kwota dotychczas oferowanego wynagrodzenia za roczną obsługę pracownika z tytułu zaliczek wynosi 15 zł. za rok (0,3%), a po wprowadzeniu obowiązku dla pracodawców rozliczenia rocznego pracowników wyniesie 17 zł. lub 20 zł. (0,35% lub 0,4%).

Obecnie nie jest możliwe znalezienia biura księgowo-rachunkowego, które za 15 zł. rocznie poprowadziłoby obsługę księgowo-płacową spraw dotyczących 1 pracownika i tym samym nie ma możliwości, żeby po wprowadzeniu obowiązku sporządzania przez pracodawców rozliczeń rocznych – jakiekolwiek biuro księgowe było w stanie świadczyć usługę rocznej obsługi księgowo-płacowej wraz ze sporządzeniem rozliczenia rocznego z uwzględnieniem niektórych ulg za 20 zł. rocznie za 1 pracownika!!! Te kwoty są wielokrotnie większe i już dziś sięgają kilkuset złotych rocznie.

Według różnych szacunków dokonywanych w różnych badaniach koszty stosowania przepisów podatkowych mogą sięgać aż do 40 % kwoty wpłacanego podatku. Wg najbardziej znanego badania z 2004 r. (Raport Komisji Europejskiej Taxation Papers, European Tax Survey, Working paper no 3/2004) koszty obsługi dla dużych przedsiębiorców zostały oszacowane na 1,9 % wartości zapłaconych podatków i 0,02 % wartości sprzedaży. Dla małych przedsiębiorców koszt zapłacenia podatku może sięgać aż 30,9 % jego wartości i odpowiada 2,6 % wartości sprzedaży. Zakładając, że zasadnicze koszty generowane są przez przepisy dotyczące cen transferowych oraz przepisy dotyczące zapłaty i zwrotu podatku VAT, można uznać że poziom 1,0 % to minimalny poziom opowiadający kosztom związanym ze stosowaniem przepisów o podatkach dochodowych (niezależnie od skali prowadzonego przedsiębiorstwa).

Konfederacja uważa również, że gwarancja odpowiedniej wysokości wynagrodzenia dla płatników powinna mieć charakter ustawowy (wprowadzenie do ustawy minimalnego poziomu wynagrodzenia)