Zgodnie z §12 ust. 1 pkt 5 rozporządzenia w sprawie VAT zwalnia się z tego podatku dostawę samochodów osobowych i innych pojazdów samochodowych, przez podatników, którym przy ich nabyciu przysługiwało prawo do odliczenia podatku naliczonego, o którym mowa w art. 86 ust. 3 ustawy, jeżeli te samochody i pojazdy są towarami używanymi w rozumieniu art. 43 ust. 2 ustawy.

Art. 86 ust. 3 ogranicza prawo do odliczenia podatku naliczonego z tytułu nabycia samochodów osobowych oraz innych pojazdów samochodowych o dopuszczalnej masie całkowitej nieprzekraczającej 3,5 tony do wysokości 60% kwoty podatku określonej w fakturze lub kwoty podatku należnego z tytułu wewnątrzwspólnotowego nabycia towarów lub kwoty podatku należnego od dostawy towarów, dla której podatnikiem jest ich nabywca. Dodatkowo takie odliczenie nie może przekroczyć 6 000 zł. Odliczenia w takiej wysokości można dokonać oczywiście pod warunkiem, że samochód ten został nabyty do wykonywania czynności opodatkowanych podatkiem VAT.

Art. 43 ust. 2 ustawy o VAT stanowi z kolei, że towarami używanymi są ruchomości, których okres używania przez podatnika dokonującego ich dostawy wyniósł co najmniej pół roku po nabyciu prawa do rozporządzania tymi towarami jak właściciel.

Co za tym idzie w przypadku sprzedaży samochodu osobowego (w stosunku do którego przysługiwało ograniczone prawo do odliczenia podatku naliczonego) po upływie co najmniej półrocznego okresu od chwili jego zakupu, czynność ta jest zwolniona z podatku VAT. Z drugiej jednak strony sprzedaż taka wiąże się niekiedy z koniecznością dokonania korekty wcześniej odliczonego podatku od nabycia tego pojazdu, na co wskazuje art. 91 ustawy o VAT. Przypomnijmy, że korekty takiej dokonuje się, jeżeli – w przypadku m.in. samochodów osobowych zaliczonych do środków trwałych o wartości początkowej przekraczającej 15 000 zł – zmiana przeznaczenia z wykorzystywania ich wyłącznie do czynności opodatkowanych na wykorzystywane wyłącznie do czynności zwolnionych (z czym mamy do czynienia w naszym przypadku – sprzedaż samochodu będzie z podatku zwolniona) nastąpiła w okresie korekty, która wynosi tutaj 5 lat licząc od roku, w którym pojazd został oddany do użytkowania. Korekty należy dokonać w wysokości 1/5 za każdy rok.

Załóżmy, że podatnik nabył samochód w 2007 r. i odliczył 6 000 zł podatku naliczonego z tego tytułu, a sprzedaje go w roku 2010, czyli w czwartym roku użytkowania. W takiej sytuacji będzie musiał skorygować 2/5 odliczonego wcześniej podatku od zakupu tego pojazdu, czyli kwotę 6 000 x 2/5 = 2 400 zł.
Kwotę tę ze znakiem minus (-) wykaże w poz. 53 deklaracji VAT-7 za miesiąc, w którym dokona jego sprzedaży

Tak skorygowany podatek będzie jednak stanowił koszt uzyskania przychodu w podatku dochodowym. Zgodnie bowiem z art. 23 ust. 1 pkt 43 ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych za koszty uzyskania przychodu nie uważa się podatku VAT, jednakże (na co wskazuje lit. c tego przepisu) kosztem takim jest kwota podatku od towarów i usług, nieuwzględniona w wartości początkowej środków trwałych oraz wartości niematerialnych i prawnych, podlegających amortyzacji lub dotycząca innych rzeczy lub praw niebędących środkami trwałymi lub wartościami niematerialnymi i prawnymi podlegającymi tej amortyzacji - w tej części, w jakiej dokonano korekty powodującej zmniejszenie podatku odliczonego zgodnie z art. 91 ustawy o podatku od towarów i usług.

W związku z powyższym w przypadku sprzedaży samochodu osobowego jako towaru używanego i konieczności dokonania korekty podatku VAT z tego tytułu, skorygowany podatek powiększy koszty uzyskania przychodu.